Décembre 2002
Suite à la Mort de Saori Kido lors de mystérieuses attaques, l'esprit de la déesse de la Guerre hante le Sanctuaire. Le contact avec elle reste toujours possible même s'il n'a jamais pu se faire jusqu'ici. En effet, la grande Athéna n'a point oublié ses guerriers et erre tristement parmi eux.
Des glorieux vétérans, seuls deux ont survécu : Shun de l'Autel et Hyoga du Verseau. A la tête du Sanctuaire depuis la disparation du Grand Pope Ikki, l'ancien chevalier d'Andromède s'efforce de relever le domaine sacré. Ce en quoi, il est aidé par les rescapés ainsi que les nouveaux chevaliers.
Bien des zones d'ombres subsistent alors que le sable rouge a laissé sa trace jusque sur les débris de la statue de la déesse Athéna. Le danger lui-même n'a pas laissé de noms précis, juste deux silhouettes féminines... Deux silhouettes dont l'une s'avéra être celle d'Amber du Corbeau. Choqués par cette trahison doublé de l'assassinat de celle que tous avaient juré de protéger, les chevaliers se redressent malgré tout, rassemblant leur force contre une menace qui ne fait encore que planer...
Tôt ou tard, les ennemis reviendront.